С 1999 года Фонд «ПРО АРТЕ» сотрудничает с Эрмитажем, организуя выставки, конференции, концерты и другие события, посвященные истории искусства 20 века и новейшему искусству. Среди совместных проектов Эрмитажа и ПРО АРТЕ ― видео инсталляции Билла Виолы и Ширин Нешат, выставки Энтони Гормли и Дэвида Хокни, лекции и доклады Рема Колхаса, Доминика Перро, Дэниэля Либескинда, Ральфа Аппельбаума, Жана-Мишеля Вильмотта, Роберта Сторра, Дэвида Эллиота, Петера Нойвера и др. Около 20 международных конференций освещают вопросы современной музейной жизни. Эрмитаж ― главный партнер Фонда «ПРО АРТЕ» в проведении Петербургской биеннале музейного дизайна.

Фонд «ПРО АРТЕ» работает в тесном сотрудничестве с Центрами-спутниками Эрмитажа в Омске, Казани, Екатеринбурге и Владивостоке в процессе подготовки и проведения ежегодного конкурса «Искусный глагол», учрежденного Государственным Эрмитажем, Благотворительным фондом Владимира Потанина и Екатеринбургским музеем изобразительных искусств для поддержки культурной журналистики в регионах России.